Este trabalho avança no entendimento da gênese do fomento de caráter interdisciplinar às ciências sociais praticado pelas agências de fomento científico, tecnológico e inovador na América Latina. Para tanto, observa os instrumentos de fomento científico das maiores agências dos dois principais países no panorama da ciência, tecnologia e inovação na região, a saber, Brasil (Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq) e México (Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología - CONACYT). A partir de uma análise comparada dos principais elementos constituintes do fomento interdisciplinar em ciências sociais nestas agências observa-se a constituição de novas formas de indução que valorizam a formação de redes de pesquisa e ensino com forte impacto na própria concepção do devir das ciências sociais. Por fim, aponta-se que a contínua interação entre ciência e sociedade promovida pelas leituras interdisciplinares em ciências sociais fomentada pelas agências em comento contribuem fortemente para  o avanço e aprofundamento das opções democráticas no continente latinoamericano.