La apertura comercial y gran parte de las políticas públicas implementadas en México se han enfocado en el fortalecimiento de los sectores secundario y terciario, especialmente en el ámbito urbano, mientras que el desarrollo y fortalecimiento del sector rural en México se ha dejado de lado. A raíz de las nuevas dinámicas económicas de los últimos años, el sector primario ha tenido que reestructurarse para responder a dichas tendencias. Las innovaciones en la agricultura ha sido lento y dirigido solo a determinados sectores y productos agrícolas específicos. Han surgido nuevas zonas productoras como es el caso del Estado de Jalisco, México, autollamado “Gigante Agroalimentario”. El objetivo de esta investigación fue analizar en qué parte de la cadena productiva se han localizado, en mayor medida, los procesos de innovación en el sector agrícola; si éstos se encuentran en la producción, organización y/o comercialización. Los datos utilizados para esta investigación provienen de dos fuentes: bases de FAO, SAGARPA e INEGI, así como de entrevistas a actores claves de dichos procesos. Algunas conclusiones previas han permitido señalar que la mayor parte de las dinámicas en el sector agrícola estan relacionadas con vacíos institucionales, y que las innovaciones son localizadas en la produción de aguacate y berries producidas por grandes productores.