En este artículo se presenta un estudio de caso orientado a explorar las oportunidades de la modalidad blended learning para el desarrollo de la autonomía intelectual en un curso de educación superior sobre aprendizaje. En el primer apartado se analizan desafíos de los ambientes de aprendizaje en la educación superior para el desarrollo de la autonomía, en el segundo se consideran las características de la modalidad que crean oportunidades para el desarrollo de la autonomía y posteriormente se presenta el caso analizado a la luz de dichas características. Se realizó un estudio de caso único de tipo global, que permitió comprender las condiciones de la modalidad blended. Los resultados mostraron que las condiciones del ambiente en esta modalidad, favorecen la autonomía externa en la media en que posibilita: el manejo claro de instrucciones, metodologías y actividades; la clarificación y manejo de metas propias; la facilitación de la interacción que demanda el trabajo en colaboración. Así mismo, hace posible un manejo flexible de los espacios y tiempos de interacción y a la vez posibilita que el centro del aprendizaje sea el estudiante. Por otra parte, la autorregulación y la motivación, como factores de la autonomía interna, se ven beneficiados en esta modalidad ya que se potencian procesos centrales de la autorregulación, como la organización para el aprendizaje y la interacción diversa y continua entre los distintos actores, haciendo que estos procesos sean visibles en los ambientes blended tanto para el estudiante como para el profesor.