Diversos estudios señalan que en el aula de ciencias han predominado tradicionalmente las metodologías tradicionales lo que ha podido influir en el dominio afectivo que manifiestan los alumnos ante materias STEM. El objetivo general ha sido analizar las creencias del profesorado en formación sobre la enseñanza/aprendizaje de las áreas STEM en la educación primaria. Para ello se han tenido en cuenta como variables objeto de estudio, diversos factores emocionales, actitudinales, cognitivos y metodológicos. El diseño de la investigación ha sido de tipo exploratorio, descriptivo y con análisis mixto de los datos obtenidos. La muestra seleccionada por muestreo no probabilístico debido a la facilidad de acceso ha estado constituida por 150 docentes en formación de la etapa de educación primaria durante sus prácticas de enseñanza. Como instrumento de medida se ha diseñado un cuestionario de elaboración propia basado en investigaciones previas. El análisis de los datos obtenidos revela la existencia de un predominio de un enfoque tradicional para la impartición de contenidos científicos en el aula de primaria. Asimismo, los resultados muestran que mejoran las emociones e interés del alumnado cuando se utilizan metodologías más activas. Respecto a la variable autoeficacia docente, los docentes en formación manifiestan bajos niveles de competencia para la enseñanza de contenidos STEM, encontrándose diferencias estadísticamente significativas (Sig.< 0.05) en función de la variable género. Los resultados obtenidos nos permiten concluir que es recomendable que los docentes de la etapa de primaria sigan innovando para procurar una evolución cognitiva y emocional positiva en el alumnado con el propósito de contribuir a la adquisición de un aprendizaje efectivo.