Uno de los principales propósitos de cualquier organización es la mejora continua y la búsqueda de la excelencia. Es bien sabido que la implantación de sistemas de verificación y acreditación en las diferentes organizaciones persigue, precisamente, este propósito. Existen estudios de análisis del efecto producido por la implantación de estos sistemas en diferentes organizaciones y, particularmente, en organizaciones educativas. Sin embargo, es escasa la literatura científica existente en este contexto donde se evalúe, no el efecto (entendido como cambios a corto y medio plazo), sino el impacto de dicha implantación en las organizaciones (entendido este como cambios sustanciales, sostenibles y perdurables en el tiempo). En el ámbito de la Educación Superior se han evaluado de diversas maneras los cambios producidos por la implantación de este tipo de sistemas en aspectos como la iniciativa emprendedora o la formación como estrategia de mejora, entre otros. Sin embargo, cabe señalar que, por un lado, existen otras muchas dimensiones de las organizaciones educativas que deben ser exploradas en este sentido y de forma conjunta; y, por otro lado, son casi inexistentes los estudios que analizan el verdadero impacto que la implantación de estos sistemas tiene en las organizaciones. De este modo, el objetivo del trabajo que aquí se presenta es especificar y definir de forma sólidamente fundamentada el diseño de un programa de evaluación que permita valorar el impacto y los efectos que los sistemas de verificación y acreditación tienen en los centros universitarios (relacionados con la mejora real del funcionamiento de las titulaciones y la formación de los estudiantes), permitiendo así identificar los factores asociados al éxito en unas organizaciones frente a otras, con el fin de impulsar la reflexión y los cambios que procedan para definir y poner las condiciones adecuadas para optimizar los procesos.