Se exponen los resultados del ejercicio investigativo sobre las manifestaciones de la interacción que se da en el departamento del Chocó entre pueblos étnicos, minería y el conflicto armado, desde la perspectiva de los Acuerdos de Paz del 2016, tomando como referente los casos de los corregimientos de Acosó (Condoto) y de Basurú (Istmina) en el departamento de Chocó – Colombia, comunidades que han sido víctimas de desplazamiento forzado por el conflicto armado. El objetivo es demostrar que el logro de una paz estable y duradera en este departamento requiere del reconocimiento y protección de los derechos Bioculturales, lo cual a su vez implica el reordenamiento del sector extractivo, especialmente oro, actividad que actualmente utiliza métodos que se encuentran generando un grave deterioro ambiental, al que se suma el financiamiento de grupos al margen de la ley. La metodología usada en este trabajo ha sido la Investigación Acción Participativa y la revisión bibliográfica documental. Así, esta investigación ha permitido concluir que a 4 años de la firma de los acuerdos de Paz, estos no han sido implementados en este departamento, evidenciado ello por la poca incidencia de la institucionalidad local, regional y nacional,  la precariedad en la prestación de los servicios públicos esenciales, por la persistencia de grupos armados, por la proliferación de cultivos de uso ilícito y por la crisis social originada por la falta de oportunidades laborales. Finalmente se concluye que la pacificación del territorio Chocoano y la conservación de la su diversidad biológica y cultural, implica una efectiva articulación entre las autoridades de todos los órdenes, incluyendo también la cooperación internacional coordinada que tenga en cuenta la interdependencia entre la demanda internacional de mercancías ilícitas y las violencias locales.