En la siguiente investigación se realizó la evaluación de las habilidades en lectura inferencial, lectura crítica y el pensamiento científico matemáticas y estadística de las Pruebas Saber Pro presentadas por los estudiantes del programa Ingeniería Comercial e Ingeniería Financiera en el año 2015 y 2016. Estos resultados se confrontaron mediante un análisis con el nivel de desempeño logrado por los mismos estudiantes en la Prueba Saber 11. En esta perspectiva, se utilizó una metodología de complementariedad entre el método cualitativo y el cuantitativo. Por un lado, se midió la relación entre variables y los niveles de eficiencia por medio del SPSS, realizando un análisis de tablas de contingencia que estima la relación comparativa de las pruebas, mediante la distribución de porcentajes. Por otro lado, el enfoque cualitativo permitió la interpretación de los datos, teniendo en cuenta los contextos estructurales y situacionales del problema, generando una propuesta pedagógica para ambos programas, con el fin de mejorar los niveles de desempeño de los estudiantes en las Pruebas Saber.