En México actualmente, la Educación a Distancia (EaD), también conocida como educación ´en línea´, ´virtual´ o ´e-Learning´, se está constituyendo como una herramienta de gran importancia sobre todo para las Instituciones de Educación Superior (IES). Sin embargo, el proceso de transición que se suscita en las IES para brindar una educación presencial a distancia resulta complejo y dificulta la consolidación de la educación virtual.Por tanto el objetivo de este trabajo es, identificar los principales desafíos en torno a la educación a distancia que enfrenta la UABC, con la finalidad de tener un panorama de la situación que guarda y permitan el diseño de posibles soluciones o recomendaciones para continuar con su desarrollo y consolidación. Se realizó un estudio cualitativo bajo el método de estudio de caso en la Facultad de Ciencias Administrativas y Sociales (FCAyS) perteneciente a la Universidad Autónoma de Baja California (UABC). En cuanto a la técnica de recolección de datos, cabe mencionar, que se aplicó una entrevista estructurada a un participante clave quien funge como Coordinador del Centro de Educación Abierta y a Distancia (CEAD) de la UABC. Los resultados destacan que, los desafíos que enfrenta la universidad están relacionados con el proceso de diversificación de cursos en línea mismos que sobre todo aluden al docente, puesto que es importante que el docente este a la vanguardia de la tecnología y participe de manera constate en cursos de capacitación en torno a las competencias digitales para impartir clases bajo esta modalidad. Así mismo, es menester diseñar estrategias para coadyuvar los desafíos a los que se enfrenta el docente los cuales están relacionados con el incremento en su carga de trabajo, atender grupos numerosos hasta la necesidad de tiempo para preparar tutorías, capacitarse y participar en el diseño e impartición de los programas que se ofertan.